西湖欧米——聚焦蛋白质组大数据技术创新,赋能精准医学和药物研发

 

【摘要】西湖欧米拥有生物、医疗、AI等不同学科背景的人才队伍,作为AI赋能、蛋白质组驱动的精准医疗技术平台,公司致力于不断优化基于质谱的微量生物样本蛋白质组分析技术,并寻找AI制药领域创新靶点。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。

 


 

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【西湖欧米-企业速览】

公司名称:西湖欧米生物科技有限公司

CEO:郭天南

注册地:浙江杭州

成立时间:2020-07-08

核心产品:AI赋能的蛋白质组学技术平台

企业愿景:AI赋能蛋白质组学的领航者 

 


 

在癌症研究领域,基因组与转录组方面的产业在过去十多年里发展迅速,而蛋白质组学是对基因组学的补充和完善,是后基因组时代极富潜力的新技术,其应用范围广泛,囊括治疗伴随诊断、新药靶点发现、药物机理毒理研究等多角度,是人类对生命活动奥秘探究的又一大突破。

 

西湖欧米正是通过将分子技术、大数据技术、人工智能与蛋白质组学相结合,以AI赋能的蛋白质组学技术为切入口,以其深耕蛋白质组学领域多年的经验,持续推动体外辅助诊断产品的面世,辅助临床诊断,助力实现肿瘤等人类重大疾病的精准辅助诊断。

 

目前,西湖欧米完成数亿元Pre-A轮融资,倚锋资本、高瓴创投共同领投,西湖科创董事长也表示将持续在资金、政策、产业等方面,全面协助欧米研发及落地以临床蛋白质组学为基石的分子诊断产品。

 

 

核心团队

 

西湖欧米搭建了一支涵盖蛋白质组学、临床医学、人工智能等交叉领域专业人才的复合团队。

 

郭天南博士是西湖大学蛋白质组大数据实验室特聘研究员,多年来一直从事蛋白质组学研究,在蛋白质组技术开发和应用上做出了多项原创性成果。在苏黎世联邦理工大学从事博士后研究期间,曾开发了一项基于质谱的微量生物样本蛋白质组分析技术,据悉,这也是 Nature Medicine 上唯一一篇关于蛋白质质谱技术相关的论文。进入西湖大学以后,郭天南博士及其团队也一直在优化和改进这项技术。

 

西湖欧米与百余家国内外知名高校与科研院所、医院、药企等建立了合作。

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蛋白质组学研究成果

 

西湖欧米董事长郭天南博士带领团队深耕研究多年,在基于质谱的蛋白质组学底层技术发展上做出了全球引领性的成果。

其主要的六项研究成果有:

1.TMT™标记定量蛋白质组学

该项研究成果可以同时比较16个不同样品中蛋白质的相对含量。

2.DIA定量蛋白质组学

该项研究成果实现了大样本队列高稳定,高精准的蛋白质组定量分析,降低样本检测的缺失值。

3.4D-DIA定量蛋白质组学

结合捕获离子淌度谱(TrappedIonMobilitySpectrometry,TIMS)和同步累积连续碎裂(ParallelAccumulationSerialFragmentation,PASEF®)技术,引入离子碰撞截面(CollisionCrossSection,CCS)维度,适用于样本数量多,同时需要获得高深度蛋白质组的临床队列课题研究。

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4.Pulse-DIA定量蛋白质组学

将同一个样本分成多次短梯度进样,每次进样方法均有不同的质谱窗口,最后合并分析几次采集的质谱数据,达到更高的多肽和蛋白质鉴定量,主要应用于需要获得最高深度蛋白质组的临床队列课题研究。

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5.磷酸化蛋白质组学

结合高特异性的磷酸化蛋白质组分离技术,利用DIA技术,实现高保真、高深度的蛋白质磷酸化修饰谱的绘制和分析,可以得到精度更高的蛋白质磷酸化修饰谱,为相关生物学、医学问题的研究提供技术支持。

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结合TMT标记定量的蛋白质组及磷酸化蛋白质组分析流程

6.靶向定量蛋白质组学

具有线性动态范围宽,灵敏度高、准确度高、重现性好等优点,在有标准品情况下,特异性也非常高。

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AI赋能的蛋白质组学数据分析平台

 

在多项蛋白质组学研究基础上,西湖欧米通过AI赋实现高效的数据处理与大规模预测,对蛋白质组的关键性质进行全面评估以及进一步与现实应用场景相结合。

西湖欧米还将AI模型嵌入整体计算生物学分析,从而在维持高精度的同时,显著提高效率。针对不同的场景,还可以训练定制化的AI模型,进一步改善预测表现,最大限度地发挥算法的优势。

 

三大产品优势及目标市场

 

目前,西湖欧米有三大产品。PCT(压力循环技术)样品制备系统由Barocycler2320EXT设备和MicroTube,MicroPestle,MicroCaps等耗材组成,为生物标志物的发现带来了前所未有的加速度和高重复性,如应用于蛋白质组学,可在3小时内从组织中提取出可用于质谱分析的肽段。

 

该产品主要客户是美国PBI公司,目前西湖欧米是PBI的PCT样本制备系统平台及其相关产品在中国的独家代理和服务商。西湖欧米不仅提供PCT相关产品的安装、维护和维修,未来还会举办PCT系列研讨会及培训班,力求为每一位PCT客户提供相关服务。

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其次就是多肽提取试剂盒。多肽提取试剂盒是西湖欧米不断改进传统PCT方法,开发了一套成熟的、快速的、稳定的基于压力循环技术的快速样本前处理方法推出的配套技术该快速PCT方法特别适用于各类微量的生物样本,甚至是牙齿、骨骼、植物组织等特殊样本,不仅能够最大限度的提取样本中的蛋白质,同时适当的加压还能加快促进完成蛋白的消化步骤,特别适用于制备高质量的MS级多肽,用于后续的蛋白组学分析。

 

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.多肽提取试剂盒工作流程

 

最后,便是西湖欧米打造的欧米云平台,可以为用户提供包括集成生信分析流程、个性化生信作图工具、多组学针对性分析、精准机器学习模型等解决方案。

 

该平台有五大优势:

1.集成生信分析流程,大量任务多节点并行

2.个性化生信作图工具,提供交互式设计图形

3.多组学针对性分析,科学化流程

4.精准机器学习模型,多样参数选择

5.专业的使用指南及报告解读

 

 

癌症早筛领域研究及计划

 

目前,西湖欧米推进蛋白质谱驱动的体外辅助诊断(IVD)产品和AI制药产品的研发,而西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。

 

目前西湖欧米针对甲状腺结节已经收集了超过3000例样品的蛋白组学分析数据,同时还收集了1000多例前瞻性样品。而且正在利用临床质谱进行数据采集和AI建模,开发针对甲状腺结节的诊断产品LDT。

 

该LDT产品将结节良恶性诊断的准确率提升到90%左右,目前正在多中心、多国家进行验证和优化。西湖欧米董事长郭天南表示,计划将于2022年第一季度对外推出甲状腺良恶性诊断的LDT。

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甲状腺结节发生率高,中国成人甲状腺结节发生率约为20.43%,平均每5个人里就有1个人有甲状腺结节。甲状腺结节有良恶性之分,但却没有特异的临床表现,因此仅靠触诊、超声检查以及体检往往无法做出精准判断,需要病理学、化验等结合才能避免“漏网之鱼”。

 

除甲状腺结节外,西湖欧米还对代谢综合征展开研究,代谢综合征大约影响了30%的成年人,且发病率随年龄增长,而逐步上升。据介绍,西湖欧米针对该类疾病已经进行了一万多个血液样品蛋白质组学样品分析。

据透露,西湖欧米还在推进一个健康诊断项目。该项目针对没有疾病表征的健康及亚健康人群,判断他们是否存在疾病征兆。其原理则是检测尿液中的蛋白,因为尿液蛋白与机体免疫和代谢密切相关,利用质谱仪检测尿液中的数千种蛋白,推出健康人群尿液蛋白质组学检测的健康诊断产品。

西湖欧米还计划在2-3年内开拓基于蛋白质标志物对多种疾病的检测,为人民健康事业持续奋斗。

 

附-里程碑

2020年7月,西湖欧米成立。

2020年11月,西湖欧米入驻西湖大学产业园。

2021年2月,西湖欧米完成种子轮融资,由辰德资本,高榕资本和高瓴创投投资。

2021年3月,西湖欧米成立欧米医学实验室。

2021年4月,西湖欧米获得3项国家专利、4项软著;正式加入全国多中心临床研究;欧米实验室开始运行;签订服务协议超过50份。

2021年6月,西湖欧米获得专利3项,软著十余项;20+know-how,与Sciex、Bruker及Thermo签订MoU(处理较小事项方面的条约)。

2021年10-11月,西湖欧米与70多家顶尖医院、科研单位、药厂构建密切合作关系,成立欧米研究院,进行四大板块(Serxice,IVD,AI,iDrug)的研究,同时建成科研服务中心。

2021年12月,西湖欧米的AI数据库获得9万多条精准数据;成为PBI中国独家代理及服务商。

 

【参考资料】

金融界《融资丨「西湖欧米」完成数亿元Pre-A轮融资,倚锋资本、高瓴创投共同领投》

西湖欧米官网《欧米快讯|西湖欧米入选2021VENTURE50新芽榜!》

生辉SciPhi《西湖欧米郭天南:AI+多组学是21世纪生命科学的重要研究领域》

西湖欧米官网

澎湃新闻《西湖大学郭天南创立公司完成新一轮融资,蛋白质组学如何驱动精准医疗?》

 

 

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三早网 的愿景与使命,是把“早筛 早诊 早治”的理念与产品,带给每个人、每个家庭,构建抵抗癌症等重大疾病的健康世界。

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